怀孕3周时，由于妊娠时间较短，一般不建议直接进行人流或药流。通常建议在怀孕40~50天左右，经超声检查确认是宫内妊娠后，再根据具体情况选择合适的终止妊娠方式。
人流的情况及注意事项
人流的适用情况：人流一般适用于妊娠10周以内要求终止妊娠且无禁忌症的女性。但怀孕3周时孕囊太小，此时进行人流手术容易出现漏吸等情况。注意事项：人流手术对女性身体有一定创伤，术后需要休息1~2周，要注意保持外阴清洁，一个月内禁止性生活和盆浴，预防感染。
药流的情况及注意事项
药流的适用情况：药物流产适用于妊娠≤49日、年龄<40岁的健康女性，且确诊为宫内妊娠。怀孕3周时同样因为孕囊过小，不适合进行药流，此时药流失败率较高。注意事项：药物流产需要服用米非司酮和米索前列醇两种药物，服药过程中可能会出现恶心、呕吐、腹痛、腹泻等胃肠道反应，而且药流有流产不全需要清宫的风险，术后也需要观察阴道流血情况等。
更早阶段的处理建议
怀孕3周时，因为妊娠时间极短，还未形成明显的孕囊，这时候如果不想要这个孩子，建议先密切观察，等待合适的时间再考虑终止妊娠。可以定期进行超声检查，监测孕囊的发育情况，在合适的孕周（40~50天左右）再根据自身情况和医生建议选择人流或药流等合适的方式。同时，无论是人流还是药流，都要选择正规的医疗机构进行，以确保安全。