脑萎缩目前尚无特效的根治药物，但可以根据具体症状使用一些药物来缓解。一般来说，对于伴有认知功能障碍的脑萎缩患者，可能会用到胆碱酯酶抑制剂等药物，不过具体用药需根据个体情况由医生决定。
改善认知功能的药物
胆碱酯酶抑制剂： 多奈哌齐是常用的胆碱酯酶抑制剂之一，它可以通过抑制胆碱酯酶的活性，增加脑内乙酰胆碱的含量，从而改善认知功能。不过，这类药物可能会有一些副作用，如恶心、呕吐等，用药需在医生指导下进行。NMDA受体拮抗剂： 美金刚也可用于脑萎缩伴有认知障碍的患者，它能调节谷氨酸活性，对中重度阿尔茨海默病等导致的脑萎缩相关认知问题有一定改善作用，但也需要在医生评估后使用。
针对伴随症状的药物
控制精神症状的药物： 如果脑萎缩患者出现精神症状，如幻觉、妄想、抑郁等，可能会用到抗精神病药物或抗抑郁药物。例如，对于抑郁症状，可能会使用选择性5 - 羟色胺再摄取抑制剂等，但药物的选择和使用剂量要严格遵循医生的建议，因为这类药物使用不当可能会带来不良影响。改善脑循环的药物： 一些改善脑循环的药物也可能会被用于脑萎缩的辅助治疗，如银杏叶提取物等，它可以促进脑部血液循环，在一定程度上可能对脑萎缩相关的脑功能有一定的改善作用，但效果因人而异。
特殊人群用药注意
老年人： 老年人使用药物时更要谨慎，因为老年人的肝肾功能可能有所减退，药物代谢能力下降，所以在使用上述改善认知功能或改善症状的药物时，需要密切监测肝肾功能等指标，根据身体状况调整用药。有基础疾病的人群： 如果脑萎缩患者同时患有其他基础疾病，如高血压、糖尿病等，在使用治疗脑萎缩相关症状的药物时，要考虑药物之间的相互作用。例如，使用降压药或降糖药的同时使用其他药物，可能会影响各自药物的疗效或增加不良反应的发生风险，所以必须告知医生自己的基础疾病情况，由医生综合评估后选择合适的药物。