腹部隐痛时，首选检查通常为CT。这是因为CT具有成像速度快、覆盖范围广的特点，能够较为便捷地完成全腹部的CT扫描，而腹部核磁共振检查一般用于进一步检查，具体应遵医嘱进行。具体如下：
一、腹部CT：主要用于检查肝脏、胆囊、胰腺、脾脏及肾脏等实性器官。
1.可以发现一些非肿瘤性的病变，如肾结石、胆囊结石等，在疾病的病因查找以及鉴别诊断方面有着重要作用。
2.但单一项检查未必能清晰直接地反映出患者的病症，有时需要结合核磁共振检查来进一步明确诊断。
二、腹部核磁共振检查：主要针对上腹部、下腹部一些实质性器官进行检查。
1.包括肝脏的肿瘤性病变、肝脏的炎性病变、肝脏的血管瘤、囊肿等，以及胰腺的占位性病变等。
2.临近的结肠若有肿瘤性病变或炎性病变等也能查出。
当出现腹部隐痛时，需要先明确是腹部的何种脏器疼痛。男性和女性在腹腔内脏器方面存在一定差别，男性腹部的主要脏器有膀胱、输尿管、肾脏以及直肠、结肠等，而女性除了上述脏器外，还包括卵巢、输卵管。而且，当出现腹部隐痛时，除了要分清不同脏器的疼痛部位，还需辨别疼痛是否存在诱因。所以对于不同的受检者、不同的诱因以及不同的症状，所采用的检查手段也是有区别的，应在医生指导下进行选择。
总结：腹部隐痛检查手段的选择要综合考虑多种因素，包括具体脏器、患者情况等，CT常作为首选，核磁共振可进一步检查，具体应遵医嘱进行。