打甲肝疫苗后可能出现一些不良反应，不过大多数比较轻微。一般来说，接种后24小时内可能会有反应。
局部不良反应：
注射部位疼痛： 接种甲肝疫苗后，少数人会在注射部位出现疼痛，通常程度较轻，一般1 - 2天可自行缓解。注射部位红肿： 还有部分人会出现注射部位红肿，红肿范围一般比较小，直径多在2 - 5厘米左右，也会在短时间内消退。
全身不良反应：
发热： 约有5% - 10%的人接种后可能出现发热，一般为低热，体温多在37.5 - 38.5℃之间，持续时间较短，大多1 - 2天就会恢复正常。疲劳乏力： 少数人会感觉全身乏力，不过这种情况通常不严重，经过适当休息后就能缓解。头痛： 个别人可能会出现头痛症状，程度一般较轻，不需要特殊处理，注意休息即可。
特殊人群的不良反应情况：
儿童： 儿童接种甲肝疫苗后的不良反应与成人类似，但儿童对疫苗的反应可能会稍有不同。一般来说，儿童出现局部疼痛、红肿以及发热等情况的比例和成人相近，但儿童的恢复通常也比较快。孕妇： 孕妇接种甲肝疫苗相对谨慎，不过目前没有发现孕妇接种后会出现特别异常的不良反应，但如果出现不良反应，需要更加密切地观察，因为孕妇的身体状况比较特殊。需要注意的是，以上不良反应大多是轻微且暂时的。如果接种后出现严重的不良反应，如高热持续不退（体温超过38.5℃且持续时间超过2天）、注射部位出现严重的化脓感染、全身严重皮疹且伴有瘙痒等，应及时就医。