打流脑疫苗后，多数人不会有明显不良反应，少部分人可能出现局部和全身反应。一般局部反应比较轻微，如接种部位在24小时内可能出现红肿、疼痛，红肿直径多在2.5厘米以内，通常1-2天能自行消退。
局部不良反应情况
红肿疼痛：接种流脑疫苗后，接种部位最常见的局部反应就是红肿和疼痛。一般来说，红肿范围不大，多数在接种后的24小时内开始出现，直径通常小于2.5厘米，疼痛程度大多比较轻微，一般不需要特殊处理，1-2天就会自行缓解。硬结形成：少数人可能会出现接种部位硬结，硬结一般也不会很大，通常在数天到一周左右逐渐消散。
全身不良反应情况
发热反应：部分人接种后可能出现发热，一般为低热，体温多在37.5-38.5℃之间，这种情况通常会在接种后的1-2天内出现，持续1-2天就会自行消退。不过也有少数人可能出现中度发热，体温在38.5-39℃之间，但一般也不需要特殊治疗，适当休息、多喝开水，体温可自行恢复正常。全身不适：还可能出现全身不适，比如乏力、精神不振等，一般程度较轻，持续时间较短，1-2天内可缓解。
特殊人群不良反应需注意
婴幼儿：婴幼儿接种流脑疫苗后，相对来说可能对不良反应的耐受程度与成人不同。比如婴幼儿出现发热时，要更加密切观察体温变化，如果体温超过38.5℃，或者发热持续时间超过3天，就需要及时就医。同时，婴幼儿接种后局部如果出现红肿等情况，要注意保持局部清洁，避免感染。过敏体质者：本身是过敏体质的人接种流脑疫苗后，发生过敏反应的风险相对较高。可能出现的过敏反应包括皮疹、瘙痒、呼吸困难等，一旦出现这些严重过敏症状，如呼吸困难、面色苍白、口唇发绀等，必须立即就医抢救。