指甲上出现小坑可能由以下原因导致：
一、伤害挫伤：当指甲遭受外力的撞击或挫伤时，就可能有小坑出现。这种情况通常无需特殊处理，指甲一般会自行进行修复。
二、甲营养不良：可能仅仅表现为指甲上有小坑，其病因较为复杂，可能和局部刺激（像修甲、美甲等）、慢性甲沟炎以及营养因素等相关。
三、灰指甲：这是由真菌感染引发的，往往会致使指甲表面呈现凹凸不平、颜色改变、质地增厚等症状。
如果此类症状持续存在或者加重，就应及时去就医。另外，银屑病、斑秃患者也常常伴有指甲上的凹点，需要注意仔细检查。同时，保持良好的个人卫生习惯以及饮食习惯，这也有助于提升指甲的健康状况。
总结：指甲上有小坑可能有多种原因，若症状持续或异常应及时就医检查，平时也要注重个人卫生和饮食来维护指甲健康。