揉眼睛有咯吱咯吱响通常属于生理现象，这与眼部结构有关。具体而言：
一、眼部结构：当闭上双眼时，结膜囊处于封闭状态，其由球结膜、睑结膜和穹窿结膜以及闭合的眼睑共同围成了一个封闭的腔体，内部会有空气存留，特别是泪囊里容易存有空气。
1.结膜囊的形成：球结膜、睑结膜和穹窿结膜以及闭合的眼睑共同构成了这个腔体。
2.空气的存留位置：主要在泪囊等部位。
二、响声产生原理：当用手按压泪囊表面皮肤时，里面的气体会发生不自主的流动，气体和泪液碰撞就会出现咯吱咯吱响声，而且积存的气体可自行吸收，无需特别在意。但如果还伴有其他不适症状，建议到医院就诊，查明病因，对症治疗。
总之，揉眼睛有咯吱咯吱响多数情况下是正常生理现象，但有其他异常时要及时就医。