接种乙脑减毒活疫苗后，少数人可能出现一些不良反应。一般来说，不良反应发生率较低。
局部不良反应
注射部位红肿：接种后24小时内，少数人可能在注射部位出现红肿，一般红肿范围较小，直径多在2 - 5厘米左右，通常1 - 3天可自行消退。局部疼痛：部分受种者会感到注射部位有轻微疼痛，一般不需要特殊处理，多数1 - 2天内可缓解。
全身不良反应
发热：约有5% - 10%的受种者可能出现发热，一般为低热，体温多在37.5 - 38.5℃之间，这种发热通常持续1 - 2天可自行消退。少数人可能出现中度发热，体温在38.5 - 39.5℃，但持续时间也较短，一般不超过3天。轻微消化道症状：个别受种者可能出现轻微的消化道症状，如食欲不振、轻度腹泻等，一般程度较轻，不需要治疗，1 - 2天内可恢复正常。
罕见不良反应
过敏反应：虽然罕见，但也有极个别受种者可能出现过敏反应，如皮疹、瘙痒等。严重的过敏反应如过敏性休克极为罕见，但一旦发生需立即就医抢救。一般过敏反应在出现后需密切观察，可根据情况给予相应的抗过敏治疗。神经系统反应：非常罕见的情况下，可能出现神经系统反应，如头痛、头晕等，但一般程度较轻，不会对身体造成严重影响，多在短时间内缓解。不过如果出现持续不缓解或加重的神经系统症状，应及时就医进行评估和处理。