眨眼时眼尾痛可能由以下原因引起。
1.麦粒肿或霰粒肿：
麦粒肿是睫毛毛囊附近的皮脂腺或睑板腺的急性化脓性炎症，可表现为眼睑局部红肿、疼痛，眨眼时疼痛加重。霰粒肿则是由于睑板腺排出管道阻塞，分泌物潴留，刺激周围组织而引起的睑板腺慢性肉芽肿。较小的霰粒肿可无明显症状，较大的霰粒肿可表现为眼睑局部圆形肿块，无明显疼痛，继发感染时可出现红肿、疼痛。
2.结膜炎或角膜炎：
结膜或角膜的炎症也可导致眨眼时眼尾痛。结膜炎常伴有眼红、异物感、分泌物增多等症状，角膜炎除了疼痛外，还可能出现畏光、流泪、视力下降等症状。
3.倒睫：
睫毛向后方生长，刺激角膜和结膜，可导致眨眼时疼痛。倒睫可由先天发育异常、眼部炎症等原因引起。
4.用眼过度：
长时间使用电脑、手机等电子设备，或长期阅读、写作等，可导致眼睛疲劳，眨眼时眼尾痛。
5.眼部外伤：
眼部受到外伤，如撞击、挤压等，可导致眼部组织损伤，引起疼痛。
6.其他：
干眼症、虹膜睫状体炎、青光眼等也可能导致眨眼时眼尾痛。
如果眨眼时眼尾痛持续不缓解或伴有其他症状，如眼红、分泌物增多、视力下降等，建议及时就医，进行详细的眼部检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，应注意眼部卫生，避免用眼过度，保持充足的睡眠。