胎记的形成主要与胚胎发育过程中的异常有关。目前研究发现，大约有10%的新生儿会出现胎记，其形成原因主要有以下几类情况。
血管异常导致的胎记
先天性血管畸形： 在胚胎发育时，原始血管网的发育出现异常，使得某些部位的血管结构发生改变。比如鲜红斑痣，它是由于真皮浅层毛细血管扩张、畸形所引起的，在出生时或出生后不久就可能出现，颜色为淡红色或暗红色，会随着年龄增长颜色逐渐加深、面积增大。血管内皮细胞增殖： 像草莓状血管瘤，是因为血管内皮细胞异常增殖形成的良性肿瘤，多在出生后1 - 2个月出现，起初是小红点，逐渐增大，突出皮肤表面，颜色鲜红。
色素沉着相关的胎记
黑色素细胞聚集： 太田痣就是由于胚胎发育时，黑色素细胞从神经嵴向表皮移行期间，停留在真皮深层而形成的。一般表现为眼周、颧骨等部位的蓝灰色、青灰色色素斑，多在出生时或儿童期出现，而且不会自行消退。色素合成异常： 咖啡斑是一种常见的色素沉着性胎记，其形成与色素合成过程中的异常有关，表现为边界清楚的圆形或椭圆形淡褐色斑，可在出生时或出生后出现，数量不等，大小从几毫米到数厘米不等。
其他因素导致的胎记
遗传因素： 有些胎记具有一定的遗传倾向，如果家族中有成员患有某种胎记相关疾病，那么后代出现类似胎记的概率可能会增加。例如某些遗传性综合征可能伴随特定类型的胎记出现。环境因素： 在胚胎发育阶段，如果孕妇受到某些不良环境因素影响，如接触过多的辐射、化学物质等，可能会干扰胚胎的正常发育，从而增加胎记形成的风险，但具体的作用机制还在进一步研究中。