查乙肝两对半可选择的科室有肝病科、传染科或感染病科。具体如下：
一、肝病科。乙肝属于肝脏疾病范畴。若医院设有肝病科，在有查乙肝两对半的需求时可挂该科。专业医生会开具相应单据来进行此项检查。
二、传染科。传染科主要诊治传染性疾病，乙肝作为一种传染性疾病，若医院设置了传染科，也可前往该科就诊。向传染科医生表明来意后，可由其开具单据进行乙肝两对半检查，部分患者可能还需要进行其他检查。
三、感染科。由于医院不同，科室设置可能存在差异，有些医院可能没有传染科但有感染科，此时同样可以前往感染科。通过检查乙肝两对半，能够了解患者是否感染乙肝病毒，还能明确病毒是否处于复制状态，这对后续的诊断以及治疗具有重要的指导意义。
总结：查乙肝两对半可根据医院科室设置情况，选择肝病科、传染科或感染病科，这些科室能进行相关检查并为后续诊断治疗提供重要依据。