阴茎萎缩可能是正常现象，也可能由内分泌紊乱、外伤、过度手淫等因素所引起。
一、正常现象：通常男性在阴茎勃起时，主要是因为阴茎海绵体内充血，使得阴茎硬度增加，同时体积也会增大。而阴茎勃起一段时间后会逐渐恢复常态，即出现萎缩现象，表现为阴茎变软、体积缩小，这属于正常的生理过程。
二、内分泌紊乱：随着年龄不断增长，人体的各个器官都会有萎缩的表现，并且阴茎的功能需要雄激素来维持，当内分泌紊乱导致机体雄激素水平降低时，就会引发阴茎萎缩。
三、外伤：如果外伤对阴茎的海绵体、血管或者神经造成了损伤，可能导致阴茎海绵体的血液供给不足，进而出现缺氧状态。最终会引起细胞凋亡和内皮细胞萎缩，促使阴茎海绵体老化，从而致使阴茎萎缩。
四、过度自慰：长期过度手淫会使海绵体长时间处于充血状态，时间久了其充血情况会逐渐减少，也就会让人感觉阴茎好像越来越小。
当患者出现阴茎萎缩的情况时，应尽快前往医院就诊，以免延误病情而造成不良后果。