宝宝幽门螺旋杆菌感染后，症状表现多样。部分宝宝可能没有明显症状，而有症状的宝宝常见的表现有消化不良相关症状，比如食欲减退，有的宝宝可能进食量较之前明显减少，还可能出现上腹部不适、腹胀等情况。还有些宝宝会有反复的腹痛，疼痛部位多在上腹部，疼痛没有明显的规律性。另外，少数宝宝可能会出现呕吐的症状，呕吐物多为胃内容物。
消化系统相关症状表现
腹痛表现： 宝宝幽门螺旋杆菌感染引起的腹痛没有固定的时间规律，可能在进食后出现，也可能在空腹时发生，疼痛程度不一，有的宝宝可能只是轻微的隐痛，有的可能会较明显，但一般不会剧烈到难以忍受。食欲改变： 感染幽门螺旋杆菌的宝宝往往食欲不佳，对平时喜欢的食物兴趣降低，这是因为幽门螺旋杆菌感染影响了胃肠道的正常消化功能，导致宝宝消化能力下降，进而不想吃东西。
其他可能伴随症状
生长发育影响： 长期幽门螺旋杆菌感染可能会影响宝宝的生长发育，因为营养吸收受到一定阻碍。比如体重增长缓慢，相较于同年龄段的健康宝宝，体重增加不明显。口腔异味： 部分感染幽门螺旋杆菌的宝宝会出现口腔异味，这是由于幽门螺旋杆菌在胃内产生一些代谢产物，通过口腔呼出表现出来。
与成人症状的不同之处
症状不典型： 宝宝幽门螺旋杆菌感染的症状不如成人典型，成人可能会有明显的反酸、烧心等症状，而宝宝更多表现为上述相对较模糊的消化不良、腹痛、食欲差等情况，这是因为宝宝的胃肠道功能和成人不同，对幽门螺旋杆菌感染的反应方式有差异。更容易被忽视： 由于宝宝不能准确表达自身的不适，家长可能不容易及时发现宝宝的幽门螺旋杆菌感染问题，比如宝宝说肚子不舒服，家长可能没往幽门螺旋杆菌感染这方面考虑，导致延误诊断和治疗。