怀孕三个月后流血可能是由自然流产、妊娠不正常、胎儿发育不正常引起。
一、自然流产：这是较为严重的状况。一方面，可能源于母亲不良的生活习惯，比如抽烟、酗酒等；另一方面，母亲自身患有某些疾病也会引发。此外，精子畸形导致胎儿自身基因缺失也是原因之一。
1.抽烟：烟草中的有害物质会对胎儿产生不利影响。
2.酗酒：酒精的摄入可能干扰胎儿的正常发育。
3.母亲自身疾病：一些疾病可能影响妊娠的稳定性。
二、妊娠不正常：以输卵管妊娠较为常见，生殖器官炎症也可能导致出血情况。
1.输卵管妊娠：可造成异常出血等问题。
2.生殖器官炎症：炎症刺激会影响妊娠状态。
三、胎儿发育不正常：可能由于某种原因致胎儿缺少维生素A，在高龄产妇中这种现象也常见，因为母亲年龄大，难以供给胎儿所需营养物质。
总之，怀孕后出血是极为严重的症状，一旦出现这种情况，务必第一时间前往医院进行专业检查，积极配合医生，尽早排除各类可能的风险。