乙肝抗病毒治疗并没有绝对“最好”的药，常用的有核苷（酸）类似物和干扰素两类。核苷（酸）类似物中，恩替卡韦和替诺福韦酯应用较为广泛。恩替卡韦能较快抑制乙肝病毒复制，一般用药后12周可使乙肝病毒DNA载量下降。替诺福韦酯对乙肝病毒的抑制作用较强，且耐药率较低。
核苷（酸）类似物类药物
恩替卡韦： 属于鸟嘌呤核苷类似物，通过抑制乙肝病毒多聚酶，阻断病毒DNA合成来发挥作用。它抗病毒作用较强，能在较短时间内降低乙肝病毒载量，但长期使用需注意可能出现的耐药情况，不过总体耐药率相对较低。替诺福韦酯： 可以干扰乙肝病毒逆转录酶的活性，从而抑制病毒复制。其抗病毒效果持久，耐药发生率低，对初治患者来说是较好的选择，而且对拉米夫定耐药的患者也有较好疗效。
干扰素类药物
普通干扰素： 分为α-2a、α-2b等亚型。它通过激活免疫系统，增强机体对乙肝病毒的免疫清除作用。一般需要每周注射3次，疗程相对固定，通常为1年左右。不过使用普通干扰素可能会出现流感样症状、骨髓抑制等不良反应，如发热、白细胞减少等，但停药后大多可恢复。聚乙二醇干扰素： 是普通干扰素的长效制剂，每周注射1次即可。它的抗病毒效果与普通干扰素类似，但在病毒学应答等方面可能有一定优势，不过价格相对普通干扰素要高一些，而且不良反应的发生情况也需要关注，比如注射部位反应等。
不同人群的用药考虑
孕妇患者： 对于孕妇乙肝患者，一般不建议使用核苷（酸）类似物进行抗病毒治疗，因为目前这些药物对胎儿的影响还不明确，可能会存在潜在风险，需要在医生的严格评估下权衡利弊。儿童患者： 儿童乙肝患者的抗病毒治疗需谨慎，要根据儿童的年龄、体重等情况来选择合适的药物。通常会优先考虑耐药风险低、安全性相对较好的药物，比如部分符合条件的儿童可以在医生评估后使用恩替卡韦等药物，但用药过程中要密切监测药物不良反应和病毒复制情况。