龟头炎的治疗药物需根据病因来选择。一般来说，细菌性龟头炎常可使用抗生素类药物，如莫匹罗星软膏等；念珠菌性龟头炎则多选用抗真菌药物，像克霉唑乳膏等。
细菌性龟头炎常用药
莫匹罗星软膏： 属于外用抗生素，能抑制细菌蛋白质合成，从而起到杀菌作用，可用于细菌感染引起的龟头炎。夫西地酸乳膏： 对引起龟头炎的常见细菌有较好的抗菌活性，能帮助消除炎症。
念珠菌性龟头炎常用药
克霉唑乳膏： 是广谱抗真菌药，通过抑制真菌细胞膜的合成发挥作用，可治疗念珠菌感染导致的龟头炎。硝酸咪康唑乳膏： 同样是抗真菌药物，能干扰念珠菌的代谢过程，达到治疗效果。
其他情况用药注意
局部清洁配合用药： 在使用药物治疗龟头炎时，同时要注意局部清洁，每天用清水清洗龟头，保持局部干燥，这样能提高药物治疗的效果。避免自行用药： 不要自行随意使用药物，尤其是激素类药物，滥用激素类药物可能会加重病情或引起其他不良反应。如果是特殊人群，如糖尿病患者合并龟头炎，在用药时更要谨慎，需在医生指导下进行，因为糖尿病患者自身抵抗力相对较弱，龟头炎的治疗需要综合考虑血糖控制等多方面因素。