吃了杀幽门螺杆菌的药后胃还是不舒服，可能是药物副作用导致，也可能是病情本身的影响等多种原因引起。一般来说，部分人服药后1-2周内可能仍有不适感觉。
药物副作用方面
药物刺激胃黏膜： 像抗生素中的阿莫西林等，可能会对胃黏膜有一定刺激，从而引起胃部不适。有些患者服用后会出现轻微的恶心、反酸等情况。质子泵抑制剂影响： 比如奥美拉唑，个别人服用后可能会有腹胀的表现，这是因为它对胃酸分泌的抑制作用，可能会打乱胃肠道的一些正常功能节奏。
病情本身因素
幽门螺杆菌感染未完全控制： 虽然服用了杀幽门螺杆菌的药物，但可能幽门螺杆菌并没有在短时间内完全被清除，胃部炎症还在持续，所以还是会感觉不舒服。一般感染比较严重的患者，这种情况可能会持续久一些。基础胃病叠加： 如果本身就有胃溃疡等基础胃病，感染幽门螺杆菌后，即使杀灭了幽门螺杆菌，原本的胃溃疡等问题还存在，也会导致胃不舒服持续存在。比如本身有胃溃疡的人，吃了杀幽门螺杆菌的药后，溃疡面的修复需要时间，短时间内还是会有疼痛、不适等感觉。
生活方式影响
饮食不当： 服药期间如果仍然吃辛辣、油腻、刺激性食物，像辣椒、油炸食品等，会加重胃的负担，导致吃完药后胃还是不舒服。比如吃了辛辣食物后，会刺激胃黏膜，引起胃部的不适症状。作息不规律： 熬夜、过度劳累等不良作息也会影响胃部的恢复。因为不规律的作息会打乱胃肠道的生物钟，影响胃的正常蠕动和消化功能，即使吃了杀幽门螺杆菌的药，胃也可能持续不舒服。