肛门潮湿可能由多种原因引起。一般来说，约70%的肛门潮湿与局部疾病相关。
肛周皮肤病导致
湿疹引发：肛周皮肤发生湿疹时，会出现红斑、丘疹，伴有剧烈瘙痒，搔抓后易渗出液体，从而导致肛门潮湿。例如过敏性体质的人，接触某些致敏物质后，肛周湿疹的发生率相对较高。神经性皮炎造成：长期精神紧张、焦虑等因素可能引发肛周神经性皮炎，表现为皮肤增厚、粗糙，有苔藓样变，也会出现肛门潮湿的情况。
肛肠疾病所致
痔疮引起：尤其是内痔脱出时，会导致肛门闭合不全，肠液容易流出，刺激肛周皮肤，引起潮湿。Ⅱ度以上的内痔患者出现肛门潮湿的概率约为60%。肛瘘造成：肛瘘外口会不断有脓性、血性、黏液性分泌物排出，刺激肛周皮肤，导致肛门潮湿。据统计，肛瘘患者中约80%会出现不同程度的肛门潮湿症状。
肠道炎症问题
肠炎引发：如溃疡性结肠炎，肠道会分泌大量黏液，若黏液从肛门流出，就会造成肛门潮湿。患者常伴有腹泻、腹痛等症状，其中约50%的溃疡性结肠炎患者会出现肛门潮湿表现。直肠炎导致：直肠发生炎症时，也会分泌过多黏液，刺激肛周，引起潮湿。急性直肠炎患者肛门潮湿症状可能较为明显。
内分泌与代谢因素
甲状腺功能减退：甲状腺功能减退患者由于机体代谢减慢，皮肤汗腺分泌减少，但肛周局部可能因其他因素出现相对潮湿情况。约30%的甲状腺功能减退患者可能会伴随肛门潮湿问题。糖尿病影响：糖尿病患者血糖控制不佳时，容易并发神经病变和血管病变，导致肛周皮肤感觉异常、汗液分泌紊乱等，进而出现肛门潮湿。糖尿病患者中约20%会出现肛周潮湿相关症状。