熊去氧胆酸胶囊主要用于治疗胆汁淤积性肝病等相关病症。它能增加胆汁酸的分泌，并且使胆汁酸成分发生变化，降低胆汁中胆固醇及胆固醇酯的含量，从而有助于溶解胆固醇性结石等。
治疗胆汁淤积性肝病
用于原发性胆汁性肝硬化：熊去氧胆酸胶囊可以改善原发性胆汁性肝硬化患者的肝功能指标，比如能降低血清碱性磷酸酶、γ - 谷氨酰转肽酶等指标水平。研究表明，长期服用熊去氧胆酸胶囊对延缓原发性胆汁性肝硬化患者病情进展有一定作用。用于其他胆汁淤积性肝病：对于一些因各种原因导致的胆汁淤积情况，像药物性胆汁淤积等，熊去氧胆酸胶囊也能发挥一定的改善胆汁淤积状态的作用，帮助缓解相关肝脏损伤。
溶解胆固醇性结石
适用于胆固醇结石：熊去氧胆酸胶囊可以用于治疗胆固醇型胆结石，它通过改变胆汁成分，使胆汁中胆固醇的饱和度降低，从而促使胆固醇结石逐渐溶解。一般来说，患者需要坚持服用一定时间，比如连续服用6个月以上，才有较好的溶解效果。对结石大小有一定要求：通常适用于X线能穿透的、直径小于2cm的胆固醇结石，并且患者胆囊功能要基本正常。如果结石过大或者胆囊功能严重不佳，可能效果不理想。
其他相关作用
改善胆汁反流性胃炎：熊去氧胆酸胶囊可以通过改变胃液的成分，减轻胆汁反流对胃黏膜的损伤，从而在一定程度上改善胆汁反流性胃炎患者的症状，如烧心、反酸等不适。调节免疫相关作用：有研究发现，熊去氧胆酸胶囊可能具有一定的免疫调节作用，不过这方面的机制还在进一步研究中，但在一些自身免疫相关的肝胆疾病治疗中也有应用的相关探索。