一般来说，脸上有扁平疣可通过如下方式去除：药物治疗、物理治疗、手术治疗。
一、药物治疗：
1.维A酸乳膏：可调节表皮细胞的有丝分裂和表皮的细胞更新，能在一定程度上改善扁平疣的症状。
2.氟尿嘧啶乳膏：对增殖细胞具有一定的抑制作用，可用于扁平疣的治疗。
3.咪喹莫特乳膏：能诱导机体产生抗病毒免疫反应，对扁平疣有治疗效果。
二、物理治疗：
1.激光治疗：利用激光的能量精准地作用于扁平疣组织，将其破坏、去除。
2.微波治疗：通过微波的热效应来消除扁平疣。
3.液氮冷冻治疗：使病变组织在低温下冷冻坏死，进而脱落。
三、手术治疗：可通过手术直接切除脸上的扁平疣，但术后要特别注意个人卫生，保持患处清洁，避免触摸伤口以防止感染。
总之，对于脸上有扁平疣的情况，可根据具体病情选择合适的治疗方法。同时，患者应遵循医嘱进行治疗和护理，以提高治疗效果和促进恢复。