怀孕三个月时同房后出血但没有腹痛，可能是以下原因引起：
1.先兆流产：怀孕前三个月胎盘尚未发育成熟，孕囊与子宫壁的连接还不紧密，此时同房可能刺激子宫收缩，导致先兆流产，引起少量出血。应及时就医，医生一般会建议卧床休息，并使用黄体酮等药物进行保胎治疗。
2.宫颈息肉：怀孕期间，孕妇体内激素水平变化可能导致宫颈息肉的出现或增大。息肉质地脆弱，同房时容易破裂出血。通常需要手术切除息肉。
3.其他：同房时动作过于粗暴、孕妇患有阴道炎或宫颈炎等，也可能导致同房后出血。
此外，前置胎盘、胎盘早剥等情况也可能引起孕期出血，但这些情况通常还伴有腹痛、胎动异常等症状。
鉴于孕期出血可能是多种严重情况的信号，建议及时就医，进行详细的检查，如超声检查、宫颈检查等，以确定出血的原因，并采取相应的治疗措施。同时，在孕期应注意休息，避免过度劳累和同房，保持良好的个人卫生，按照医生的建议进行产前检查。如果出血量较多、颜色鲜红或伴有其他不适症状，应立即就医或拨打急救电话。