宝宝三个月脖子软，可能由以下原因引起：
1.颈部肌肉发育不完善：宝宝三个月时，颈部肌肉尚未完全发育，可能会导致脖子软。这是正常的生理现象，随着宝宝的成长，颈部肌肉会逐渐强壮，脖子也会变得更有力。
2.缺钙：宝宝缺钙可能会导致骨骼发育不良，包括颈部骨骼。如果宝宝饮食中缺乏钙，或者钙的吸收不良，可能会出现脖子软的情况。
3.其他疾病：某些疾病也可能导致宝宝脖子软，如先天性甲状腺功能减退症、脑瘫等。如果宝宝还有其他异常表现，如反应迟钝、吃奶差、呼吸困难等，应及时就医，进行相关检查和治疗。
针对宝宝脖子软的问题，可以采取以下措施：
1.多让宝宝趴着：趴着可以锻炼宝宝的颈部肌肉，帮助增强颈部力量。
2.给宝宝进行适当的按摩：按摩可以促进宝宝的血液循环，帮助颈部肌肉发育。
3.保证宝宝的营养均衡：给宝宝提供足够的奶量和富含钙的食物，如奶制品、豆制品、绿叶蔬菜等。
4.按时带宝宝进行体检：及时发现问题并采取相应的措施。
如果宝宝脖子软的情况持续存在或伴有其他异常症状，建议及时就医，以便明确原因并进行针对性治疗。