甲状腺功能减低症通常不存在最佳治疗方法，一般可通过以下方式进行医治：
一、病因治疗：
1.如果能明确甲状腺功能减低症的病因且可去除，就应实施病因治疗，这是极为重要的治疗手段。比如，对于缺碘性甲状腺功能减低症应予以补碘，药物引发的甲状腺功能减低症应减少药量或停用后等，通常甲状腺功能减低症就会自行消退。
2.若是下丘脑或垂体有肿瘤而导致甲状腺功能减低症，在肿瘤切除手术后，甲状腺功能减低症可能会在不同程度上得到改善。此类甲状腺功能减低症在原发病治好后，其症状也会消失或减轻。
二、甲状腺激素替代治疗：
采用甲状腺激素进行替代治疗甲状腺功能减低症。这种直接补充甲状腺素制剂的方式，治疗周期短且效果显著。持续服用适量的甲状腺激素制剂，有利于患者病情的稳定。但患者采用此治疗方法时，必须依据医生的建议，合理确定服用量与服用时间，切不可自行增减药量。
总之，对于甲状腺功能减低症，要根据具体情况选择合适的治疗方法，同时严格遵循医嘱进行治疗和用药调整。