下唇内侧起透明水疱可能是以下原因引起的：
1.创伤：进食时不小心咬伤下唇内侧，或使用质地较硬的牙刷过度摩擦，可能导致局部黏膜受损，形成水疱。
2.感染：单纯疱疹病毒感染可引起口唇疱疹，水疱可发生于下唇内侧。此外，手足口病、球菌性口炎等感染性疾病也可能导致唇部水疱。
3.过敏：接触过敏原后，唇部可能出现变态反应，表现为水疱、肿胀、瘙痒等症状。
4.营养不良：维生素B2、B6、B12等缺乏可能导致唇部黏膜变薄、干燥，容易起水疱。
5.其他：内分泌失调、免疫功能异常等也可能引起唇部水疱。
针对不同原因引起的水疱，治疗方法也有所不同。如果水疱较小，无明显不适，可注意口腔卫生，避免刺激，等待其自然吸收。如果水疱较大，或伴有疼痛、肿胀等症状，可在医生指导下使用抗病毒药物、抗生素、抗过敏药物等治疗。此外，还应针对病因进行治疗，如补充维生素、调节内分泌等。
需要注意的是，唇部水疱可能是多种疾病的表现，在自行处理的同时，建议及时就医，明确诊断，以便采取更针对性的治疗措施。同时，应避免食用辛辣、刺激性食物，避免吸烟、饮酒，以免加重症状。