直肠炎中医治疗可通过中药内服、中药灌肠等方式进行。一般来说，中医治疗直肠炎需辨证论治。
中药内服治疗
湿热下注型： 常表现为腹痛、腹泻，大便带黏液脓血，肛门灼热等。可选用白头翁汤加减，其中白头翁有清热解毒、凉血止痢的作用，黄连、黄柏能清热燥湿，秦皮可清热燥湿、收涩止痢。脾虚湿盛型： 多见大便溏薄，夹有黏液，神疲乏力，食欲不振等。常用参苓白术散加减，方中人参、白术、茯苓、甘草健脾益气，山药、莲子肉、白扁豆等健脾化湿，砂仁、陈皮理气醒脾。
中药灌肠治疗
药物选择： 可选用黄柏、苦参、地榆、白及等中药煎液进行灌肠。黄柏清热燥湿；苦参清热燥湿、杀虫止痒；地榆凉血止血、解毒敛疮；白及收敛生肌。一般将药物煎好后，温度适宜时保留灌肠，通过直肠黏膜吸收药物，直接作用于病变部位。操作注意： 灌肠前患者需排空大便，灌肠时动作要轻柔，药液温度不宜过低，以免刺激肠道引起不适，一般建议药液温度保持在37~39℃左右。
针灸推拿辅助治疗
针灸： 根据直肠炎的不同证型选取相应穴位。如湿热下注型可选取天枢、合谷、曲池等穴位，天枢为大肠募穴，能调理大肠气机；合谷、曲池清热解表。脾虚湿盛型可选取脾俞、胃俞、足三里等穴位，脾俞、胃俞健脾和胃，足三里是强壮要穴，能健脾益胃、理气降逆。针刺手法根据病情虚实而定，实证用泻法，虚证用补法。推拿： 可采用腹部按摩的方法，患者仰卧，操作者用手掌顺时针按摩腹部，每次15~20分钟，每天1~2次，能促进肠道蠕动，调节脾胃功能，有助于改善直肠炎引起的不适症状，但推拿时力度要适中，避免用力过猛。