男性尿道炎的治疗药物需根据病原体来选择。一般来说，细菌感染引起的尿道炎常用抗生素治疗，比如左氧氟沙星等喹诺酮类药物对常见的致病细菌有较好效果。
细菌性尿道炎常用药
喹诺酮类药物：左氧氟沙星是常用的喹诺酮类抗生素，它能抑制细菌DNA旋转酶，阻碍细菌DNA复制，从而发挥杀菌作用，对多数引起尿道炎的细菌有良好抗菌活性。头孢类药物：头孢克肟也是治疗细菌性尿道炎的常用药，属于头孢菌素类抗生素，通过抑制细菌细胞壁的合成来杀菌，对革兰氏阳性菌和阴性菌都有一定作用。
非细菌性尿道炎相关药物
衣原体、支原体感染用药：如果是衣原体或支原体引起的尿道炎，常用阿奇霉素。阿奇霉素能与细菌核糖体结合，抑制细菌蛋白质合成，一般服用疗程相对有规定，需遵医嘱使用。还有多西环素，它可以抑制细菌蛋白合成，从而起到抗菌作用，但要注意8岁以下儿童不建议使用多西环素。
特殊人群用药注意
老年人：老年人患尿道炎用药时要特别注意，因为老年人肝肾功能可能有所减退，使用抗生素需谨慎评估。比如使用左氧氟沙星时，要监测肾功能情况，根据肾功能调整可能的用药剂量或选择其他相对肾损伤小的药物。过敏体质者：如果患者对某些抗生素过敏，比如对头孢类药物过敏，那就不能使用头孢类药物治疗尿道炎，需要换用其他不过敏的抗生素，如大环内酯类抗生素等，但具体要由医生根据病情来选择合适药物。
非药物辅助注意事项
在药物治疗的同时，男性尿道炎患者要注意大量饮水，每天饮水量最好保持在2000毫升以上，这样可以增加尿量，通过尿液冲洗尿道，有助于疾病的恢复。同时要注意个人卫生，保持尿道口清洁，避免不洁性生活等，这些非药物措施也对尿道炎的康复有帮助。