肛窦炎最明显的症状主要有肛门部坠胀感，一般这种坠胀感会持续存在，有时还会在排便后加重。另外，疼痛也是常见症状之一，疼痛程度不一，有的患者是轻微的刺痛，有的则可能较为明显，尤其在排便时，粪便刺激发炎的肛窦，疼痛可能会加剧。还有部分患者会出现肛门分泌物增多的情况，分泌物可从肛门流出，弄湿内裤，有时分泌物呈稀薄状。
坠胀感的具体表现
久坐后加重：患者长时间坐着时，肛窦部位受压迫，坠胀感会更明显，一般坐1 - 2小时后就会感觉肛门有明显坠胀不适。排便时影响：在排便过程中，由于粪便通过肛门，会刺激发炎的肛窦，导致坠胀感进一步加重，有的患者甚至会觉得有便意不尽的感觉。
疼痛的特点
刺痛感为主：肛窦炎引起的疼痛多为刺痛，就像有小针刺扎一样，尤其是在粪便摩擦肛窦时，这种刺痛感会比较明显。与排便的关联：排便前疼痛可能会逐渐加重，排便时达到一个较明显的程度，排便后疼痛会有一定程度的缓解，但不会完全消失。
分泌物增多的情况
量的变化：病情较轻时，分泌物量相对较少，可能只是内裤上有少量潮湿感；病情较重时，分泌物量会增多，有时会呈点滴状流出，甚至在不排便时也会有分泌物渗出。分泌物性状：分泌物一般为稀薄的黏液状，颜色多为透明或微黄色，如果合并有感染，分泌物可能会变得浑浊，甚至带有少量血丝。