乙肝抗体阴性查出小三阳，可能与以下因素有关。
1.假阳性：乙肝五项检查可能会出现假阳性结果，尤其是在乙肝五项全阴的情况下。这可能与试剂、检测方法、个体差异等因素有关。可以考虑复查乙肝五项，或者进行乙肝病毒DNA检测等进一步明确诊断。
2.窗口期：乙肝病毒感染后，需要一定的时间才能产生足够的抗体，这段时间称为窗口期。在窗口期内，乙肝抗体可能尚未出现，但乙肝病毒已经存在。因此，即使乙肝抗体阴性，也不能排除乙肝感染。
3.隐匿性感染：部分乙肝感染者，由于免疫功能低下或其他原因，乙肝病毒未能被及时清除，而处于隐匿性感染状态。此时，乙肝表面抗原（HBsAg）可为阳性，但乙肝抗体阴性。
4.其他因素：一些其他疾病，如自身免疫性疾病、恶性肿瘤等，也可能导致乙肝五项检查结果异常。
需要注意的是，小三阳（乙肝表面抗原、乙肝e抗体、乙肝核心抗体阳性）并不一定意味着病情严重，需要进一步结合肝功能、乙肝病毒DNA定量、肝脏B超等检查结果综合判断。如果对检查结果有疑问或担忧，建议及时咨询医生，医生会根据具体情况进行评估和解释，并提供相应的建议和处理方案。此外，对于乙肝小三阳患者，需要定期复查，关注病情变化，必要时进行抗病毒治疗。同时，应注意个人卫生，避免与他人共用牙刷、剃须刀等可能导致血液传播的物品。