女性尿完尿小肚子疼可能由多种原因引起，常见的有泌尿系统感染、膀胱过度活动症、尿路结石等。
一、泌尿系统感染
泌尿系统感染是常见原因，如膀胱炎。细菌等病原体入侵泌尿系统，引发炎症反应，在排尿后可能刺激膀胱及周围组织，导致小肚子疼痛，常伴有尿频、尿急等症状。女性尿道短而直，较易发生泌尿系统感染，尤其在性生活后、不注意个人卫生时更易出现。
二、膀胱过度活动症
膀胱过度活动症也会导致这种情况。膀胱逼尿肌不稳定，出现不自主收缩，使得膀胱功能紊乱，在排尿后可能仍有小肚子不适，多伴有尿频、尿急等表现，其具体病因尚不十分明确，可能与膀胱感觉过敏、神经调节异常等有关。
三、尿路结石
尿路结石也是原因之一。当结石在尿路中移动时，可能损伤尿路黏膜，引起疼痛，排尿后结石位置变化等可能刺激局部，导致小肚子疼痛，还可能伴有血尿等症状，结石的形成与代谢、饮食等多种因素相关。
四、其他因素
一些特殊情况也可能导致，如间质性膀胱炎，这是一种慢性膀胱炎症，会出现膀胱疼痛、尿频等症状，排尿后小肚子疼痛可能较为明显；对于绝经后的女性，由于雌激素水平下降，尿道黏膜变薄，也容易发生尿路感染等问题，进而出现尿完尿小肚子疼的情况。