早上起来胃不舒服可能由多种原因引起。比如，有研究表明，约10% - 20%的人会在晨起时出现胃部不适的情况。
一、生理因素导致
夜间胃酸分泌： 人体在夜间会持续分泌胃酸，虽然有黏液等保护，但如果夜间胃酸分泌相对过多，且胃内没有食物缓冲，就可能刺激胃黏膜，导致早上起来胃不舒服。一般夜间胃酸分泌量相对白天有一定规律变化。胃肠蠕动变化： 睡眠时胃肠蠕动会减慢，经过一夜，胃内可能会有一些残留物质，晨起后胃肠开始活动，可能会引起不适。比如正常人睡眠时胃肠蠕动频率比清醒时低约30%左右，晨起后逐渐恢复正常频率，这个过程中可能出现不适。
二、饮食相关因素
前晚饮食不当： 如果前一天晚上吃了过多辛辣、油腻食物，像晚餐吃了大量油炸食品，这些食物不易消化，会加重胃肠负担，经过一夜，早上就容易出现胃不舒服。例如，吃了过多辣椒后，辣椒素会刺激胃黏膜，导致晨起胃部不适。空腹时间过长： 有些人夜间长时间空腹，比如空腹超过8 - 10小时，胃内胃酸没有食物中和，会对胃黏膜产生刺激，引起晨起胃不舒服。正常情况下，胃内有食物时能缓冲胃酸，空腹过久就易出现这种情况。
三、疾病因素影响
胃炎： 患有慢性胃炎的人，胃黏膜本身有炎症存在，夜间胃酸分泌等情况可能会诱发晨起胃不舒服。比如慢性萎缩性胃炎患者，胃黏膜功能受损，更容易在晨起时出现不适。十二指肠溃疡： 十二指肠溃疡患者常常会有空腹疼痛的特点，因为夜间胃酸会进入十二指肠，刺激溃疡面，导致早上起来胃不舒服。有数据显示，约60%的十二指肠溃疡患者会在空腹时，包括晨起时出现疼痛等不适症状。