发烧后全身疼主要是因为身体在感染等因素刺激下，免疫系统被激活，释放如前列腺素等炎性介质，这些介质会作用于神经末梢，导致全身肌肉等组织出现酸痛感。
感染性发热致全身疼
感染病原体（如细菌、病毒等）引发发烧时，身体的免疫反应会使肌肉产生酸性物质堆积，同时炎性介质刺激神经，从而造成全身疼痛，常见于流感等病毒感染或肺炎等细菌感染引发的发烧情况。
非感染性发热致全身疼
一些非感染性因素，像自身免疫性疾病等也可引起发烧及全身疼，例如类风湿关节炎活动期，身体免疫系统错误攻击自身组织，伴随发烧时就会出现全身关节肌肉疼痛。
儿童发烧后全身疼需关注
儿童发烧后全身疼要留意体温变化及精神状态，因为儿童表达能力有限，若持续全身疼且精神差，可能提示病情较重，需及时就医评估，非感染因素导致的儿童发烧全身疼也需谨慎对待。
老年人发烧后全身疼要重视
老年人发烧后全身疼，由于身体机能下降，恢复能力弱，需警惕潜在的严重疾病，如肺炎、泌尿系统感染等，应密切观察症状变化，必要时尽早就诊，避免延误病情。