卵巢囊肿的引起原因较为复杂，目前认为可能与多种因素有关。一般来说，卵巢囊肿的形成并非单一因素导致，而是多种因素综合作用的结果。
内分泌因素
排卵相关： 卵巢是排卵、分泌性腺激素的重要器官，排卵过程中卵巢表面上皮细胞会不断修复，若受到一些不良因素影响，就可能引发囊肿。比如女性在长期的高压力、不健康生活方式等情况下，内分泌容易紊乱，影响排卵，进而增加卵巢囊肿的发生风险。据统计，约有一定比例的卵巢囊肿与内分泌紊乱导致的排卵异常等情况相关。激素水平影响： 雌激素、孕激素等激素水平的异常变化也和卵巢囊肿有关。例如，体内雌激素水平过高，可能刺激卵巢组织异常增生，形成囊肿。一些长期服用激素类药物的人群，卵巢囊肿的发生率相对会高一些。
生活方式因素
饮食不均衡： 长期饮食结构不合理，如经常吃高胆固醇、高油腻的食物，而蔬菜水果摄入不足，会影响身体的新陈代谢，可能增加卵巢囊肿的发病几率。有研究发现，饮食中缺乏足够的维生素等营养物质，会干扰卵巢的正常功能，从而诱发囊肿。长期压力过大： 现代社会中，很多女性长期处于高压力状态下，会影响身体的内分泌调节机制。长期的精神压力可导致植物神经功能紊乱，使卵巢组织功能失调，细胞增生异常，容易形成囊肿。长期熬夜等不良生活习惯也会加重这种内分泌失调的情况，进而促进卵巢囊肿的形成。
环境因素
环境污染： 长期处于被污染的环境中，如接触工业污染物、农药残留等，这些环境中的有害物质可能通过各种途径进入人体，干扰内分泌系统和卵巢的正常功能，增加卵巢囊肿的发生可能性。例如，生活在污染严重地区的人群，卵巢囊肿的发病率可能相对偏高。辐射影响： 长期受到过量的辐射照射，如经常接触X射线等，也可能对卵巢组织造成损伤，影响卵巢的正常生理功能，引发卵巢囊肿。不过，日常生活中一般的少量辐射接触通常不会直接导致，但长期大剂量的辐射暴露则需要警惕。