阴茎里面疼可能是由尿道结石、尿道炎、尿道肿瘤等疾病引起，具体如下：
一、尿道结石：
1.当尿道内有结石时，结石的刺激会导致尿道黏膜充血水肿，进而引起阴茎里面疼。
2.处理方法：可在医生指导下使用排石药物，如排石颗粒。若治疗效果不佳，可用金属探子将结石推入膀胱内，之后再进行碎石治疗，把结石击碎成小块，以利于结石排出。
二、尿道炎：
1.尿道炎包括普通型尿道炎、淋菌性尿道炎和非淋菌性尿道炎，炎症刺激可使尿道黏膜充血水肿，从而导致阴茎里面疼。
2.处理方法：需遵医嘱服用头孢克肟、阿奇霉素等敏感度高的抗生素药物。
三、尿道肿瘤：
1.若尿道内有肿瘤，随着肿瘤不断生长会侵犯周边组织，这也会引起阴茎里面疼。
2.处理方法：这种情况需要到医院就诊，然后根据肿瘤性质进行针对性处理，比如进行全尿道切除。
总结提示：当出现阴茎里面疼时，要考虑可能是上述这些疾病导致的，应及时就医进行明确诊断，并根据具体病因采取相应的治疗措施。