如果女性自然流产没有流干净，可能导致以下三种后果：
一、损伤子宫、感染炎症：女性自然流产没干净需进行清宫处理，而这一操作会对子宫内膜造成一定损伤，使其逐渐变薄，进而影响日后正常受孕。并且若术后护理不佳，容易引发炎症，患上妇科疾病。比如可能导致子宫内膜炎，出现下腹疼痛、白带增多等症状；还可能引发盆腔炎，引起下腹坠胀、疼痛及腰骶部酸痛等表现。
二、细菌感染：若女性所选医院不正规，医生做手术时器械未完全消毒，或未注重无菌环境创建，女性在手术中就极有可能出现子宫内感染。若细菌感染未及时发现清除，甚至会感染到输卵管和骨盆腔，从而容易导致女性不孕。比如可能引起输卵管炎，造成输卵管堵塞；还可能导致盆腔炎症，出现发热、下腹疼痛等情况。
三、宫颈或内膜粘黏：女性做清宫手术时若医生操作技术欠佳，容易出现子宫穿孔。若子宫内有异物滞留，易出现大出血、月经淋漓不尽甚至不孕等后果。比如可能出现严重的出血，导致贫血等问题；还可能因月经异常影响女性的正常生活和生育。
总之，女性自然流产后若未流干净会带来诸多严重后果，应引起高度重视并及时进行妥善处理。