湖州男科医院比较好的有湖州市中心医院、湖州市第一人民医院、湖州市南浔区人民医院。
一、湖州市中心医院：它始建于1931年，最初名为浙江省立医院。承担着湖州以及安徽宣城、江苏吴江等周边地区400多万人口的医疗保健任务。在2005年成为三级甲等综合性医院，2013年成为浙江大学湖州医院，2018年被列为全国现代医院管理制度试点单位，2019年牵头建立湖州市中心医院医疗保健集团，涵盖了吴兴区的8个社区卫生服务中心。2020年升级为浙江大学医学院附属湖州医院，开启了与浙大二院的全面深入合作。
二、湖州市第一人民医院：湖州市第一人民医院医疗保健集团于2019年3月组建成立，由湖州市第一人民医院牵头，成员单位包括吴兴区人民医院，以及埭溪、八里店、东林、织里、道场、妙西等6家乡镇卫生院（含63个站点），构建起了市、区、乡镇层面“一线直通、覆盖全域、服务连续”的整合型医疗服务体系。该集团有工作人员2257名，所管理地区的常住人口达85万，流动人口将近90万，2018年全年的就诊人次达到了244万。
三、湖州市南浔区人民医院：它始建于1947年10月，是一所集医疗、教学、科研、预防保健、康复、社区卫生于一体的二级甲等综合性医院。新医院占地面积123亩，建筑面积7.7万平方米，包含住院综合楼（18层）、医疗综合楼（4层）和后勤综合楼（5层），是一所环境优美、设备先进、配套完善的现代化花园式医院。目前开放床位600张，设有48个临床专科、14个医技科室和13个病区。共有职工600余人，其中中高级职称有200余人，浙江省325高层次人才医坛新秀有2人，湖州市名医生有2人。它是卫生部“爱婴医院”、国家级流感哨点医院、浙江省文明单位、浙江省绿色医院、浙江省无烟医院、浙江省平安医院。
患者可依据自身实际情况来选择合适的医院就诊。
总结概况提示：湖州有多家男科方面较为出色的医院，如湖州市中心医院、湖州市第一人民医院、湖州市南浔区人民医院，它们在医疗资源、服务体系、医院规模与实力等方面各有特点，患者可按需选择。