运动神经元病的治疗目前尚无根治方法，但可以通过多种手段改善症状、延缓病情进展。一般来说，主要的治疗方式包括药物治疗、康复治疗等。
药物治疗方面
利鲁唑：是目前被多个国际指南推荐的治疗运动神经元病的药物，它可以通过抑制谷氨酸释放，来延缓病情进展，一般需要长期服用。依达拉奉：是一种自由基清除剂，可通过静脉给药，能改善患者的功能减退速度，在发病后6个月内开始使用可能效果较好。
康复治疗方面
物理治疗：包括运动疗法等，根据患者的具体情况制定个性化的运动计划，比如进行适当的关节活动度训练、肌力训练等，有助于维持肌肉力量和关节活动范围，一般建议每周进行数次物理治疗。语言治疗：如果患者出现吞咽困难、语言障碍等问题，语言治疗师会针对患者情况进行相应训练，帮助改善语言和吞咽功能，通常需要定期进行语言治疗。
呼吸管理方面
呼吸功能监测：对于病情进展出现呼吸肌无力的患者，需要定期监测呼吸功能，如肺活量等指标，一般建议每3 - 6个月进行一次呼吸功能评估。呼吸支持：当患者肺活量明显下降等情况时，可能需要使用无创呼吸机甚至有创呼吸机来辅助呼吸，以保证患者的通气功能。
营养支持方面
营养评估：要定期对患者进行营养评估，包括体重、营养指标等，一般每个月进行一次营养状况评估。营养干预：根据评估结果给予相应的营养支持，比如对于吞咽困难的患者可能需要鼻饲或者胃造瘘来保证营养摄入，保证患者每天能摄入足够的热量和蛋白质等营养物质。