莫名其妙发高烧可能由多种原因引起。比如感染性因素较为常见，像病毒感染可能导致体温异常升高，像流感病毒引起的流感，会让人体体温在数小时内迅速升高到38℃以上甚至更高。
感染性因素导致的高烧
细菌感染： 当人体受到细菌入侵时，比如肺炎链球菌引发肺炎，就可能出现莫名其妙发高烧的情况。细菌在体内繁殖会释放毒素，刺激人体免疫系统，从而引起体温调节中枢紊乱，导致体温升高。病毒感染： 除了流感病毒，像EB病毒引起的传染性单核细胞增多症，也会出现长时间的发烧，体温可达到39℃左右，还可能伴有咽痛、淋巴结肿大等症状。
非感染性因素导致的高烧
自身免疫性疾病： 例如系统性红斑狼疮，这是一种自身免疫紊乱的疾病，患者体内的免疫系统错误地攻击自身组织，会出现间歇性的高烧，体温波动在38.5℃ - 40℃之间，同时可能伴有面部红斑、关节疼痛等表现。恶性肿瘤： 像白血病等血液系统恶性肿瘤，由于骨髓中异常细胞大量增殖，会释放致热物质，导致患者莫名其妙地发高烧，体温可能持续在38℃以上，还可能伴有贫血、出血等症状。
其他可能因素
环境因素： 长时间处于高温环境中，比如在炎热的夏季，室内通风不良，人体散热困难，也可能出现体温短暂升高，但一般不会超过38.5℃，离开高温环境后，体温通常能逐渐恢复正常。药物热： 服用某些药物后也可能引起发烧，比如抗生素类药物，有些人群在使用青霉素类药物后，可能会出现药物热，体温一般在用药后几天内升高，停药后体温会逐渐下降。