柠檬加蜂蜜有一定的保健功效。例如，适量饮用柠檬蜂蜜水有助于补充水分等。
缓解咽喉不适方面
润喉作用：柠檬中含有柠檬酸等成分，蜂蜜有一定的润滑咽喉的效果。当咽喉感到干燥、不适时，用温水冲泡柠檬蜂蜜水饮用，能在一定程度上舒缓咽喉的不适感。比如对于一些经常用嗓的人，如教师等，偶尔饮用可以暂时缓解咽喉的轻微干燥感。不过，如果咽喉不适较为严重，不能仅依靠柠檬蜂蜜水，还是需要就医诊治。辅助减轻炎症刺激：蜂蜜中的一些成分可能对轻微的咽喉炎症有一定的辅助缓解作用，柠檬中的维生素C等成分也有一定的抗氧化等作用，综合起来可能对咽喉局部的不适有一定的改善，但这只是辅助，不能替代药物治疗。
促进消化方面
刺激胃酸分泌：柠檬中的酸性物质可以刺激胃酸分泌，而蜂蜜相对比较温和，适量饮用柠檬蜂蜜水可能有助于食物的消化。一般来说，在饭后1 - 2小时左右饮用一杯淡淡的柠檬蜂蜜水，可能会对消化有一定的帮助。不过，对于本身胃酸分泌过多、有胃溃疡等胃部疾病的人，要谨慎饮用，以免加重胃部不适。比如有胃溃疡的人饮用后可能会刺激胃黏膜，导致疼痛等症状加重。帮助肠道蠕动：蜂蜜中的一些糖类等成分可以在一定程度上调节肠道的渗透压，可能有助于肠道的正常蠕动。柠檬中的膳食纤维等成分（虽然柠檬中的膳食纤维含量相对不是特别高，但也有一定作用）也能对肠道蠕动有一定的促进作用，不过这种促进作用比较温和，对于严重消化不良的人，不能单纯依赖柠檬蜂蜜水来解决问题，还是需要通过调整饮食结构等更科学的方式。
美容养颜方面
补充维生素：柠檬富含维生素C等多种维生素，维生素C具有抗氧化作用，能够对抗体内的自由基，有助于延缓皮肤的衰老。蜂蜜中也含有一些维生素等营养成分，饮用柠檬蜂蜜水可以为皮肤补充一定的营养物质，从内而外对皮肤有一定的滋养作用。例如，坚持每天饮用适量的柠檬蜂蜜水，长期下来可能会让皮肤看起来更有光泽，但这种效果不是立竿见影的，需要长期坚持。不过，柠檬蜂蜜水不能替代专业的美容护肤产品，如果皮肤有严重的问题，还是要寻求专业皮肤科医生的帮助。改善肌肤状态：由于柠檬蜂蜜水有一定的促进消化等作用，身体内部环境得到改善后，皮肤的状态也会相应得到改善。比如消化功能好了，身体代谢正常，皮肤可能会减少长痘痘等问题的几率。但每个人的皮肤状况不同，对柠檬蜂蜜水的反应也不一样，而且美容养颜是一个综合的过程，不能只依靠饮用柠檬蜂蜜水。