药物流产有一定风险，并非绝对安全。一般来说，药物流产适用于妊娠≤49日、年龄小于40岁的健康女性，但成功率约为90%左右，存在流产不全等情况的可能。
适用人群有局限
药物流产有明确的适用人群限制，通常要求妊娠时间在49天以内，并且是正常宫内妊娠。同时，年龄一般要小于40岁，且身体状况良好，没有心血管疾病、青光眼、哮喘等不适合药物流产的疾病。比如，若妊娠超过49天，药物流产失败几率会大大增加，可能需要进行清宫手术。
可能出现的问题
流产不全：
药物流产后有10%左右的概率出现流产不全的情况，也就是宫腔内还有妊娠组织残留。这时候就需要再次进行清宫手术，对子宫会造成二次伤害。例如，残留的妊娠组织会影响子宫收缩，导致阴道流血时间延长，出血量增多，甚至可能引起贫血、感染等问题。
阴道流血时间长：
药物流产后阴道流血时间一般会持续1 - 2周，甚至更长时间。正常情况下，月经量的阴道流血时间在3 - 7天，而药物流产后超过这个时间仍有较多阴道流血，会增加感染的风险。因为长时间的阴道流血会使女性生殖系统处于开放状态，细菌容易入侵，引发子宫内膜炎、盆腔炎等妇科炎症。
安全注意事项
药物流产必须在有正规抢救条件的医疗机构进行，并且要在医生的监护下使用。用药前需要进行B超检查，确定是宫内妊娠才能进行药物流产。服药后要密切观察阴道流血情况以及有无妊娠组织排出。如果阴道流血量过多，超过平时月经量的2倍以上，或者出现剧烈腹痛等异常情况，要立即就医。而且，药物流产后要注意休息，加强营养，一个月内禁止性生活和盆浴，防止感染。