唇腭裂的发生是多种因素综合作用的结果。目前研究发现，大约有2% - 3%的新生儿会出现唇腭裂情况。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 如果家族中有唇腭裂患者，那么后代发生唇腭裂的风险会增加。比如，若父母一方患有唇腭裂，其子女患病的概率比普通人群高出数倍。有研究表明，唇腭裂是一种多基因遗传性疾病，多个基因的异常可能共同导致唇腭裂的发生。特定基因变异： 某些特定基因的变异与唇腭裂的发生密切相关。例如，一些涉及胚胎发育过程中面部结构形成的基因，如MSX1、IRF6等基因发生突变时，就可能干扰面部正常的发育过程，从而增加唇腭裂发生的可能性。
孕期母体因素影响
营养缺乏： 孕妇在孕期如果缺乏某些重要营养素，如叶酸、维生素B12等，会影响胚胎的正常发育。尤其是叶酸，它对细胞的分裂和生长起着重要作用，孕期叶酸缺乏会使胎儿面部发育出现异常，增加唇腭裂发生的风险。一般建议孕妇从孕前3个月开始补充叶酸，直至孕期满3个月。药物影响： 孕妇在孕期服用某些药物也可能导致胎儿唇腭裂。比如，孕期服用抗癫痫药物，可能会干扰胚胎面部发育的正常进程，增加胎儿患唇腭裂的几率。所以孕妇用药一定要在医生的严格指导下进行，不能自行随意服药。感染因素： 孕期感染某些病毒，如风疹病毒等，也可能引发胎儿唇腭裂。孕妇在孕期要注意预防感染，尽量避免去人群密集、容易感染疾病的场所，如果感染了病毒要及时就医治疗。
环境因素作用
辐射暴露： 孕期如果孕妇接触过多的辐射，像在放射科工作或者经常接触有辐射的电子产品等，可能会影响胎儿的发育，增加唇腭裂发生的风险。一般建议孕妇尽量远离高辐射环境，如非必要，避免进行X线等辐射性检查。吸烟饮酒： 孕妇吸烟或饮酒会对胎儿产生不良影响。吸烟产生的烟雾中含有多种有害物质，饮酒会影响营养物质的吸收和代谢，这些都会干扰胎儿面部的正常发育，使唇腭裂的发生风险升高。所以孕妇一定要戒烟戒酒，同时也要避免接触二手烟。