碘131治疗甲亢的副作用包含：放射性甲状腺炎，诱发甲状腺危象，加重活动性Graves眼病，甲状腺功能减退。
一、放射性甲状腺炎：主要因过度破坏甲状腺组织细胞，致使外周在短时间内释放大量甲状腺激素，进而出现甲状腺区显著疼痛，通常发生于碘131治疗后约1周。症状较轻者可自行恢复，严重者需给予如泼尼松等糖皮质激素进行医治。
二、诱发甲状腺危象：主要在未得到控制的严重甲亢重症患者中发生，其原因主要为短期内大量甲状腺激素释放入血。一旦发生，需紧急使用抗甲状腺药物及糖皮质激素等药物予以治疗。
三、加重活动性Graves眼病：为防止这种情况，对于活动性Graves眼病患者，一般在进行碘131治疗前1个月给予口服泼尼松治疗，在碘131治疗后3至4个月逐渐减少药量。
四、甲状腺功能减退：大部分甲亢患者接受碘131治疗后，都会出现不同程度的甲状腺功能减退，需要口服甲状腺激素进行治疗。
总之，碘131治疗甲亢虽然有一定效果，但也存在多种副作用，需要密切关注并采取相应的应对措施。