阴茎根部里面隐隐作痛可能由多种原因引起，以下是一些可能的情况：
1.前列腺炎：前列腺位于阴茎根部深处，前列腺炎可能导致疼痛、尿频、尿急等症状。
2.尿道炎：尿道炎症也可能引起阴茎根部疼痛，同时可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。
3.附睾炎或精索静脉曲张：附睾和精索位于阴囊内，靠近阴茎根部，炎症或静脉曲张可能导致疼痛。
4.阴茎硬结症：阴茎海绵体硬结症可引起阴茎弯曲和疼痛。
5.外伤：阴茎根部受到直接外伤或剧烈的性行为可能导致损伤和疼痛。
6.其他原因：神经痛、感染、结石等也可能引起类似症状。
如果疼痛持续或加重，建议及时就医。医生会进行详细的身体检查和可能的实验室检查，以确定具体原因并制定适当的治疗方案。在等待就医期间，应注意以下几点：
1.避免过度性行为或刺激阴茎。
2.保持阴茎清洁。
3.避免长时间久坐或穿着过紧的内裤。
4.注意个人卫生，避免感染。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，具体情况可能因个体差异而异。医生的诊断和治疗是最准确和有效的。如果对阴茎根部的疼痛感到担忧，最好咨询专业的医生以获得准确的建议和治疗。