上下颚咬合耳根处疼痛可能存在以下两种情况：一是颞下颌关节痛，二是智齿冠周炎导致咬合时耳根处疼痛。具体如下：
一、颞下颌关节痛：
1.表现：颞下颌关节区会有疼痛，可能伴随弹响或杂音，张口或咀嚼时关节周围肌群产生疼痛，多呈持续性，且有疼痛点。疼痛可能引起咀嚼肌痉挛和张口困难，严重时还可能伴有头痛、耳痛等症状。
2.原因：可能由咬合不正引起。
3.应对措施：要及时进行咬合矫正。若出现关节疼痛，需到医院就诊，根据病情进行关节保护、理疗或其他系列治疗。
二、智齿冠周炎：
1.表现：常出现牙龈红肿、溢脓，局部有压痛，因智齿位置靠近耳根处，所以常会放射至耳根处疼痛。
2.应对措施：治疗以局部冲洗上药为主，可在医生指导下服用抗生素等药物，同时要配合口腔清洁，用温热盐水或其他含漱剂清洁口腔。
总之，当出现上下颚咬合耳根处疼痛时，要明确具体原因，以便采取针对性的治疗措施。