扁平疣可以外用维A酸类药膏，比如0.1%维A酸乳膏，一般连续使用数周可能会有效果。
维A酸类药膏作用
0.1%维A酸乳膏： 能调节表皮细胞的增殖和分化，促进角质剥脱，从而改善扁平疣症状，但使用时可能会有局部刺激，如红斑、脱屑等。他扎罗汀凝胶： 属于第三代维A酸类药物，作用机制与维A酸类似，对扁平疣也有一定疗效，不过使用时要注意避免接触正常皮肤，且孕妇禁用。
抗病毒类药膏
干扰素凝胶： 具有抗病毒和免疫调节作用，可通过抑制病毒复制来发挥作用。一般需要坚持使用一段时间，比如连续使用1~3个月左右，部分人使用后扁平疣会逐渐消退。酞丁安乳膏： 能抑制病毒DNA（脱氧核糖核酸）和蛋白质的合成，从而起到抗病毒效果，对扁平疣有一定治疗作用，但使用过程中要注意观察局部皮肤反应。
其他外用药膏
5%氟尿嘧啶软膏： 有一定腐蚀性，可使疣体坏死、脱落，但因为有刺激性，可能会引起疼痛、色素沉着等不良反应，现在临床使用相对少些。水杨酸软膏： 可以促进表皮剥脱，对于扁平疣也有一定的治疗作用，不过使用时要注意控制浓度和范围，避免过度刺激皮肤。需要注意的是，外用药膏治疗扁平疣的效果因人而异，而且如果扁平疣数量较多、面积较大，可能还需要结合其他治疗方法，如激光、冷冻等。同时，在使用外用药膏时要遵循医生的指导，注意药物的不良反应和使用禁忌等情况。