卵巢囊肿的引起原因较为多样，其中生理性因素较为常见，比如在月经周期中，卵泡发育到一定阶段未正常排卵，就可能形成生理性卵巢囊肿，这种情况在育龄女性中较常见，部分会在月经结束后自行消失。
内分泌因素
激素失衡影响： 女性体内的雌激素、孕激素等激素平衡对卵巢功能起着重要调节作用。当内分泌失调时，比如长期熬夜、精神压力过大等情况，可能会干扰卵巢的正常排卵和激素分泌，从而增加卵巢囊肿的发生风险。像一些多囊卵巢综合征患者，就常常伴有卵巢囊肿的问题，这与她们体内雄激素水平升高等内分泌紊乱状况密切相关。促黄体生成素异常： 促黄体生成素分泌异常也可能引发卵巢囊肿。如果促黄体生成素水平出现波动，会影响卵巢的正常生理功能，导致卵巢组织异常增生，进而形成囊肿。
生活方式因素
不良饮食习惯： 长期摄入高胆固醇、高糖的食物，或者饮食不规律等，都可能对卵巢健康产生不利影响。例如，长期大量食用油炸食品、甜食等，会使身体处于一种代谢紊乱的状态，影响卵巢的正常代谢和功能，增加卵巢囊肿发生的可能性。缺乏运动： 长期缺乏体育锻炼，身体的新陈代谢会变慢，身体的免疫力也可能会下降，这会影响卵巢的血液循环和正常生理调节，使得卵巢组织更容易出现异常变化，增加卵巢囊肿的发病几率。
环境因素
环境污染影响： 长期处于被污染的环境中，比如接触过多的化学物质、重金属等，这些有害物质可能会通过各种途径进入人体，干扰内分泌系统和卵巢的正常功能，从而增加卵巢囊肿的发生风险。比如生活在化工厂附近的人群，接触到较多污染物，患卵巢囊肿的概率可能相对较高。辐射影响： 长期受到辐射照射，也可能对卵巢造成损伤，影响其正常的生理活动。例如长期从事放射工作的人员，如果没有做好防护措施，卵巢受到辐射影响后，发生囊肿的几率会有所增加。