男生感染HPV后，症状表现因感染类型不同而有差异。大多数男生感染低危型HPV时，可能没有明显症状，部分人会出现生殖器疣，表现为生殖器部位出现单个或多个淡红色小丘疹，逐渐增多变大，可呈菜花状、乳头状等外观。而感染高危型HPV时，早期也多无明显症状，少数人可能会有生殖器部位的异常变化，长期高危型HPV感染可能增加患阴茎癌等恶性肿瘤的风险，但一般不会很快出现明显的肿瘤症状，通常需要数年甚至更长时间才可能发展为可见的病变。
低危型HPV感染症状表现
生殖器疣表现： 一般在感染后数周或数月内出现症状。好发部位多见于阴茎、阴囊、肛周等部位。初期是细小的淡红色丘疹，随着病情发展，丘疹会逐渐增大增多，表面凹凸不平，湿润柔软，呈乳头样、菜花样或鸡冠样突起，颜色可为红色、污灰色或正常肤色。症状出现时间： 从感染低危型HPV到出现生殖器疣的时间因人而异，一般在3周~8个月，平均为3个月左右。
高危型HPV感染早期表现
无明显局部症状： 感染高危型HPV后，男生的外生殖器等部位通常没有特殊的自觉症状，皮肤表面看起来可能和正常一样，很多人是在体检或因其他疾病检查时偶然发现感染情况。长期感染的潜在风险： 高危型HPV持续感染是引发阴茎癌等恶性肿瘤的重要危险因素，但这个过程比较漫长，可能需要几年、十几年甚至更长时间才会逐渐出现局部病变的迹象，比如阴茎局部出现肿块、溃疡、出血等异常情况，但这时候往往已经不是早期表现了。
HPV感染后的特殊情况
免疫力影响症状： 男生自身免疫力较好时，可能会在感染低危型HPV后，依靠自身免疫系统清除病毒，不出现明显的生殖器疣症状。而如果免疫力较低，就更容易出现明显的疣体等症状。对于高危型HPV感染，免疫力正常的男生也有可能在一段时间后清除病毒，但免疫力低下者就更易导致病毒持续感染，增加患癌风险的概率会相对更高。与其他疾病的区别： 男生生殖器部位出现的一些病变需要与HPV感染导致的病变相鉴别。比如阴茎珍珠状丘疹，这是一种发生在阴茎冠状沟的良性病变，表现为白色、肤色或淡红色的小丘疹，成行排列，无自觉症状，与HPV感染的生殖器疣不同。还有假性湿疣，多发生在女性阴唇，但男性也可能出现类似表现，表现为阴茎龟头及冠状沟部位的鱼子状、绒毛状小丘疹，一般也与HPV感染无关。