包皮炎可以根据不同病因选择相应药物。一般来说，细菌感染引起的包皮炎可选用抗生素类药膏，真菌感染引起的包皮炎则需用抗真菌药物。
细菌感染导致的包皮炎用药
局部外用抗生素药膏：如果是细菌感染引发的包皮炎，常用的有莫匹罗星软膏。莫匹罗星软膏对多种革兰阳性球菌有抗菌作用，能抑制细菌生长。比如局部出现红肿、疼痛、有脓性分泌物等细菌感染表现时，可涂抹莫匹罗星软膏。不过，使用时要注意保持局部清洁，用药前先清洗包皮及龟头部位。夫西地酸乳膏：也是针对细菌感染的药物，它可以抑制细菌蛋白质的合成，从而发挥抗菌作用。对于轻度的细菌感染性包皮炎有较好的疗效。
真菌感染导致的包皮炎用药
抗真菌药膏：要是由真菌感染引起的包皮炎，像克霉唑乳膏就比较常用。克霉唑乳膏能抑制真菌细胞膜的合成，影响其代谢过程。当包皮炎表现为局部瘙痒明显、有白色分泌物等真菌性表现时，可选用克霉唑乳膏。使用时要避免接触眼睛和其他黏膜部位。还有酮康唑乳膏，它同样属于抗真菌药物，通过干扰真菌细胞色素P450的活性，影响真菌细胞膜的合成，达到抗真菌的效果。
其他情况的处理及注意事项
保持局部清洁：无论哪种原因引起的包皮炎，都要注意保持包皮腔的清洁卫生。每天用清水清洗包皮和龟头，清除污垢，防止炎症加重。比如每天至少清洗1 - 2次，清洗时要将包皮上翻彻底清洁。避免刺激：患病期间要避免性生活，同时要避免搔抓、摩擦局部，以免加重炎症。还要注意穿着宽松的棉质内裤，减少对包皮局部的摩擦和刺激。如果是儿童患有包皮炎，家长要更加留意孩子的局部情况，及时清洁护理，必要时在医生指导下用药，因为儿童皮肤较为娇嫩，用药需谨慎。