打黄体酮针可能会有一些副作用。一般来说，常见的副作用包括头晕、恶心、嗜睡等，大约有部分人使用后会出现这类较轻的反应。
局部反应方面
注射部位疼痛： 打黄体酮针时，约有10% - 20%的人会出现注射部位疼痛的情况，这是比较常见的局部反应。有些人可能是在打针瞬间就感觉到疼痛，还有些人可能在打针后几小时内，注射部位会有持续的隐痛。局部红肿： 少数人打完黄体酮针后，注射部位可能会出现红肿现象，不过一般红肿程度较轻，多数在数天内会自行消退。但如果红肿范围逐渐扩大或者伴有发热等症状，就需要及时就医。
全身反应方面
头晕嗜睡： 大约有15% - 30%的人打完黄体酮针后会出现头晕、嗜睡的情况。有些人可能在打针后马上就感觉头晕，想睡觉，这种情况在白天打针后可能会影响正常的工作和生活，一般在用药后的1 - 2天内可能会逐渐缓解。胃肠道不适： 部分人会出现恶心、呕吐等胃肠道不适症状，大概占10%左右。有些人体质比较敏感，可能在打针后不久就会觉得恶心，严重的可能会出现呕吐，影响食欲。
对月经相关的影响
月经周期改变： 黄体酮针常用于调节月经等情况，不过使用后可能会导致月经周期出现一定改变。比如原本月经周期比较规律的人，使用后可能会出现月经提前或者推迟的情况，一般提前或推迟1 - 2周内属于常见情况，但如果超过2周仍未恢复正常月经，就需要进一步检查。乳房胀痛： 少数人在打黄体酮针后会出现乳房胀痛的情况，这是因为黄体酮对乳房有一定的影响，一般胀痛程度较轻，在停药后会逐渐缓解。