附睾囊肿通常不会自愈。附睾囊肿是一种良性疾病，是由于附睾管阻塞或局部分泌失调导致的附睾内囊性病变。较小的附睾囊肿通常不会引起明显症状，也不需要特殊治疗，但需要定期进行超声检查，以监测其大小变化。如果附睾囊肿较大，或引起明显的疼痛、坠胀等不适症状，或影响生育能力，则需要进行治疗。治疗方法包括手术治疗和非手术治疗，具体治疗方法需要根据患者的具体情况来选择。
对于较小的附睾囊肿，如果没有明显症状，且不影响生育能力，通常不需要治疗，只需定期进行超声检查，以监测其大小变化。如果附睾囊肿较大，或引起明显的疼痛、坠胀等不适症状，或影响生育能力，则需要进行治疗。手术治疗是治疗附睾囊肿的主要方法，一般采用附睾囊肿切除术或附睾切除术。非手术治疗包括药物治疗和物理治疗，药物治疗主要用于缓解疼痛、坠胀等不适症状，物理治疗主要包括热敷、冷敷、按摩等。
需要注意的是，附睾囊肿的治疗方法需要根据患者的具体情况来选择，患者应在医生的指导下进行治疗。同时，患者在日常生活中应注意保持良好的生活习惯，避免长时间久坐、骑车等，避免过度性生活，保持局部清洁卫生，预防感染。