龟头炎的治疗药物需根据病因选择，一般细菌感染引起的龟头炎可选用抗生素类药物，如莫匹罗星软膏等，通常用药后几天内症状会有所改善。
细菌性龟头炎常用药
莫匹罗星软膏： 属于外用抗生素，能抑制细菌蛋白质合成，从而发挥抗菌作用，可用于革兰阳性球菌引起的细菌性龟头炎。一般局部外用，每天3次左右，用药时需注意避免接触眼睛和其他黏膜。红霉素软膏： 对大多数革兰阳性菌、部分革兰阴性菌及一些非典型致病菌如衣原体、支原体均有抗菌活性。适用于细菌感染导致的龟头炎，外用，涂于患处，一日2次左右。
念珠菌性龟头炎常用药
克霉唑乳膏： 为抗真菌药，作用机制是抑制真菌细胞膜的合成，以及影响其代谢过程。可用于念珠菌性龟头炎，外用，涂擦于洗净患处，一日2 - 3次。使用时要注意如果用药部位有烧灼感、红肿等情况应停药，并将局部药物洗净。咪康唑乳膏： 对念珠菌属具有抗菌作用，通过干扰细胞色素P - 450的活性，从而抑制真菌细胞膜主要固醇类 - 麦角固醇的生物合成，损伤真菌细胞膜和改变其通透性，致使重要的细胞内物质外漏。用法为外用，涂搽于洗净的患处，一日2次。
滴虫性龟头炎常用药
甲硝唑： 是治疗滴虫感染的常用药物，它可以干扰滴虫的氧化还原代谢，促使其死亡。对于滴虫性龟头炎，可口服甲硝唑片，但要注意孕妇及哺乳期妇女禁用，有活动性中枢神经系统疾患和血液病者禁用。
注意事项
个人卫生方面： 无论哪种类型的龟头炎，保持局部清洁都很重要。每天用清水清洗龟头和包皮，避免使用刺激性强的清洁剂。避免性生活： 在治疗龟头炎期间，应避免性生活，防止交叉感染，同时也能让患处更好地恢复。特殊人群： 对于儿童发生龟头炎，家长要格外注意，不要自行随意用药，应及时带孩子就医，由医生根据具体情况选择合适的药物。老年人有龟头炎时，也要谨慎用药，最好在医生指导下进行，因为老年人可能伴有其他基础疾病，用药需要考虑药物相互作用等因素。